Ķīmiskā sintēze: To plaši izmanto ķīmiskās sintēzes jomā, ieskaitot organisko sintēzi, polimēru sintēzi un katalītiskās reakcijas. Šāda veida reaktori ļauj sajaukt un karsēt reaģentus noteiktā temperatūrā un spiedienā, lai atvieglotu ķīmiskās reakcijas, savukārt tā noslēgtā konstrukcija nodrošina operatora drošību.
Zinātnes par dzīvību: tas tiek plaši izmantots zinātnēs par dzīvību. Piemēram, magnētiski maisāmus reaktorus var izmantot šūnu kultūras un fermentācijas procesos, lai uzlabotu produkta iznākumu un tīrību. Turklāt tos izmanto farmaceitisko līdzekļu un biomolekulu ražošanā.
Materiālzinātne: to var izmantot arī materiālu zinātnē, piemēram, nanomateriālu, keramikas un metāla apdares sintēzē. Kontrolējot temperatūru un maisīšanas ātrumu, reaktors var mainīt materiālu struktūru un īpašības.
Kurināmā elementi: to plaši izmanto kurināmā elementu ražošanā. Reaktors atvieglo dažādu ķīmisko vielu sajaukšanu un karsēšanu, lai ražotu kurināmā elementiem nepieciešamās sastāvdaļas.
Izmantojot magnētisko reaktoru, ir jāievēro noteikti drošības pasākumi, piemēram, pareizi jāuzstāda un jānoregulē magnētiskais maisītājs, jāizvairās no pārmērīgu reaģentu izmantošanas un jāuzrauga iekšējā spiediena un temperatūras svārstības.